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焊接式无菌取样阀的基本工作原理为当处于关闭状态时,依靠弹簧张力或其它压力推动顶针,由顶针将密封胶头压紧在罐壁的开孔处,达到密封效果;如果需要取样时,从其中一个(一般是下方的)取样口通入蒸汽或其它灭菌介质,将整个样品室内充满并从另一个取样口导出,经过一定时间的作用后使样品室和取样口处于无菌状态;然后通过拧动旋柄,收缩弹簧,放松顶针,使得密封胶头从罐壁上的开孔处脱离,从而使样品从罐内经过样品室流出,并从取样口收集;取样完成后,拧动旋柄,放松弹簧,通过顶针再次将密封胶头压紧在罐壁的开孔处;通入洁净水将样品室内的残液排出(如果是样品为无菌水等较干净的介质时,这一步可以省略),然后注入灭菌介质进行密封留存,待下一次取样。
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